中国科学院微生物研究所期刊联合编辑部
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301.
肠道菌群与人体健康密切相关,目前已有多种肠道菌群健康指数,以辅助评价肠道菌群乃至人体健康。膳食是调节肠道菌群的主要因素之一,但尚无合适的方法用于评价膳食因子调节效果。为了评估膳食因子对超重人群肠道菌群的调控效果,基于17种膳食因子进行了体外发酵实验,并使用基于主成分分析的肠道菌群… …   相似文献
302.
【背景】灰葡萄孢(Botrytis cinerea)是引起植物灰霉病的病原菌,严重威胁着各种重要经济作物的产量。化学防治是最有效的一种防治措施,其中,琥珀酸脱氢酶抑制剂类(succinate dehydrogenase inhibitor, SDHI)杀菌剂是防治灰霉病的一类常用杀菌剂,但目前灰葡萄孢已对其产生抗性。【目的】建立一种能快速检测对SDHI杀菌剂产生抗性的灰葡萄孢菌株的方法。【方法】以SdhBP225F点突变为材料,通过设计特异性引物,优化PCR体系退火温度和内参引物浓度、评价等位基因特异性PCR (allele-specific PCR, AS-PCR)的灵敏度和特异稳定性,最后以快速提取的田间菌株的DNA为模板进行AS-PCR检测,并将检测结果与测序结果进行比对。【结果】AS-PCR引物对P225F-3F/P225F-R在退火温度为58 ℃,内参引物浓度为2.5 μmol/L时可稳定区分抗性和敏感菌株,灵敏度为10 fg/μL,粗提田间菌株的AS-PCR检测结果与测序结果一致。【结论】该AS-PCR检测方法操作简单、灵敏度高、特异性强,可为田间灰葡萄孢对SDHI抗性菌株的快速检测提供一种较为可行的方法。… …   相似文献
303.
  
江西省乐安县牛田镇古樟林素有“中国第一古樟林”之美称,拥有3 000余棵100–1 200年的古樟树,现已被列为国家生态公益林加以保护。为探明该古樟林不同树龄香樟菌根类型及AM真菌种类多样性,本研究采用根系组织染色、根际土壤AM真菌孢子过筛分离,以及显微形态观察的方法进行了研究和… …   相似文献
304.
糖尿病慢性创面具有难愈性、反复进展性和较高的致残/死亡率等特点,其临床治疗是亟待解决的医学难题之一。因其复杂的局部微环境,如高蛋白酶活性和持续的炎症反应等,使外源性因子(如趋化因子CXCL12)在局部慢性创面的生物利用率非常低,限制了外源性因子在慢性创面的局部应用。本研究利用合成… …   相似文献
305.
【背景】人冠状病毒OC43 (human coronavirus OC43, HCoV-OC43)属β冠状病毒,其感染会对免疫低下的老人和幼儿的健康带来严重威胁。FB2001作为已进入临床试验的抗冠状病毒主蛋白酶3CLpro抑制剂,前期研究表明其对HCoV-OC43也具有良好的抗病毒活性,但HCoV-OC43对FB2001的耐药特征有待阐明。【目的】研究HCoV-OC43 3CLpro对FB2001产生的耐药突变位点及耐药机制,发现冠状病毒对3CLpro抑制剂耐药的共性特征,对广谱抗冠状病毒3CLpro小分子药物的开发和优化改造具有重要意义。【方法】通过在体外进行药物压力下连续传代实验获得具有明显耐药表型的HCoV-OC43耐药适应株,二代测序(next generation sequencing, NGS)发现病毒3CLpro上存在多个突变位点,然后构建HCoV-OC43 3CLpro Flip GFP活细胞酶活系统验证耐药突变特征,最后通过Alphafold 3和DiffDock人工智能平台获得突变蛋白-小分子的结合模式,分析耐药机制并通过生长竞争试验研究耐药适应株的生长适应性变化。【结果】耐药适应株3CLpro出现D65G、L165V、I300T、D65G+L165V氨基酸突变,这些突变均会导致3CLpro在HEK-293T细胞中对FB2001的敏感性降低,其中L165V造成的耐药特征最显著;3CLproL165V-FB2001复合物结构预测显示,突变后第165位的Val侧链残基改变3CLpro活性中心S1位局部构象,导致蛋白酶与FB2001的P1位亲和力下降;生长竞争试验结果表明,耐药适应株在与HCoV-OC43野生株的生长竞争中不具有生长竞争优势。【结论】本研究提示冠状病毒主蛋白酶对P1位为γ-内酰胺环的拟肽抑制剂具有耐药共性机制。… …   相似文献
306.
尿酸(uricacid,UA)是人体内嘌呤的最终代谢物,若人体内尿酸生成和排泄稳态失调导致血液中尿酸含量升高,将会引起高尿酸血症(hyperuricemia,HUA)。人体约有1/3的尿酸经肠道排泄,而肠道菌群作为肠道内环境的重要组成部分,在调节血液尿酸水平方面发挥重要作用,其组… …   相似文献
307.
  
盘菌是指子实体呈盘状的一类非地衣型真菌。该类真菌生境广泛、种类多样,并具有多种生态类型。广西崇左地区是桂西南喀斯特的典型代表区域,蕴藏着丰富的生物多样性资源,然而对该地区的盘菌资源多样性现状缺乏研究。本研究选取桂西南喀斯特地区的崇左白头叶猴保护区、弄岗保护区和青龙山保护区为研究区… …   相似文献
308.
309.
聚乙烯(polyethylene,PE)因其优异的性能被广泛应用。然而,废弃聚乙烯的不合理处置造成严重的环境污染。聚乙烯微生物降解是一种低碳、环保的高效同级回收利用方法,利用微生物降解技术处理聚乙烯废弃物成为当前研究的热点之一。采用富集培养方法从垃圾填埋场废弃塑料中筛选出一株PE… …   相似文献
310.
产毒素大肠杆菌(enterotoxigenic Escherichia coli, ETEC)感染是制约畜牧业发展的一大因素。然而,抗生素的滥用势必引发细菌耐药与药物残留问题,且现有疫苗难以有效激发肠道免疫,预防效果不佳。因此需要开发一种安全的、能激活肠道免疫、适宜作为饲料添加剂的新型疫苗。本研究旨在通过基因工程技术,构建携带ETEC DNA疫苗的酵母菌体微胶囊(yeast-cell microcapsules, YCM),并通过动物实验探究饲喂YCM对动物肠道免疫系统的调节作用及其对肠道菌群的潜在影响。选用酿酒酵母菌体作为DNA疫苗的口服递送载体—“微胶囊”,合成密码子哺乳动物源优化的ETEC主要抗原K88核酸序列,利用重组DNA技术构建含有相应DNA疫苗表达盒的酵母穿梭载体,转化酿酒酵母菌株JMY1制备相应的YCM重组菌株。进一步通过荧光报告实验、胃肠液耐受实验、肠上皮细胞黏附实验、肠道滞留性评估、抗血清检测和肠道菌群检测等一系列的实验检测全面评估了YCM菌株的特性及作为口服疫苗的可行性。实验结果显示,DNA疫苗表达盒能够在哺乳动物中有效表达,YCM重组菌能够耐受长达8 h的胃肠液消化,并对肠上皮细胞具有良好的黏附力。小鼠饲喂实验结果表明,YCM重组菌能够在肠道内滞留至少2周,且其所携带的DNA疫苗表达盒能够进入肠道免疫系统并引发免疫反应,诱导产生特异性抗体。此外,饲喂YCM重组菌还能改善小鼠肠道菌群丰度,在调节肠道菌群方面展现了积极作用。综上所述,本研究制备了携带ETEC DNA疫苗的YCM重组菌株,全面评估了其作为口服疫苗的特性及可行性,确认了饲喂YCM重组菌能够诱导特异性免疫反应并调节肠道菌群,为ETEC相关动物疾病的免疫预防提供了参考和借鉴。… …   相似文献
311.
氯苯类污染物(chlorobenzenes,CBs)对生态环境造成严重威胁,功能菌株在该类污染场地修复中具有重要应用潜力。为深入解析功能菌在CBs原位生物修复中的应用潜力,本研究基于已分离的粘质沙雷氏菌(Serratiamarcescens)TF-1,开展了土壤中氯苯(chlorobenzene,CB)和1,2-二氯苯(1,2-dichlorobenzene,1,2-DCB)生物转化特性和降解动力学研究,并应用该菌株进行了化工污染场地原位修复试验。批次血清瓶实验结果表明,污染物浓度为20–200 mg/L时,TF-1对CB的降解速率为0.22–0.66 mol/(gcell·h),降解过程符合Haldane模型,最佳活性浓度为23.12 mg/L。实验室模拟污染土壤降解结果显示,TF-1与琥珀酸钠(sodiumsuccinate,SS)联合应用可显著提高CBs的降解效果,CB的降解速率常数最高为0.104d–1,半衰期为6.66d;1,2-DCB的降解速率常数最高为0.068 7 d–1,半衰期为10.087 d。化工污染场地原位修复结果显示,注入菌剂和SS对CBs污染物去除效果显著,10d后去除率达到84.2%–100%,CB、1,4-二氯苯(1,4-dichlorobenzene,1,4-DCB)和苯并[a]芘均被完全去除。微生物多样性分析表明原位修复实现了TF-1定殖和土著微生物固氮弧菌属(Azoarcus)的富集,Azoarcus可能在降解中发挥关键作用。本研究为氯苯类污染场地的原位生物修复提供了理论依据和实践经验。… …   相似文献
312.
【背景】松材线虫病是一种对林木危害严重的森林病害,而捕食线虫性真菌可以利用其捕食器官捕食松材线虫,从而实现对松材线虫病的有效防治。【目的】鉴定分离出一株捕食线虫性真菌并探究其最适生长和产孢条件,为松材线虫的生物防治提供一定的参考依据。【方法】使用ITS2、RPB2TEF1-α序列对该菌株进行分子生物学鉴定,同时结合其形态特征确定其具体所属种属。观察该菌株在不同温度、pH和营养条件下的生长状况及变化规律,明确其具体的生物学特性。【结果】形态学鉴定结果及分子生物学鉴定结果表明该捕食线虫性真菌为强力节丛孢(Arthrobotrys robusta)。该菌株最适生长和产孢条件有所不同。最适生长条件为28 ℃、pH 10.0-11.0、玉米粉琼脂(corn meal agar, CMA)培养基、碳源为淀粉、氮源为KNO3。最适产孢条件为30 ℃、pH 8.0、马铃薯葡萄糖琼脂(potato dextrose agar, PDA)培养基、碳源为淀粉、氮源为蛋白胨。【结论】该捕食线虫性真菌为强力节丛孢,对不同环境具有较强的适应能力,在各种环境下除部分极端环境外均能良好生长,对松材线虫具有良好的生防潜力。… …   相似文献
313.
  
溃疡性结肠炎(ulcerative colitis, UC)是一种慢性炎症性肠病,对患者生活质量产生长期严重影响。本研究从桑黄Sanghuangporus sanghuang中提取多糖,采用葡聚糖硫酸钠(dextran sulfate sodium, DSS)建立小鼠溃疡性结肠炎… …   相似文献
314.
【背景】由腐皮镰孢(Fusarium solani)引起的根腐病严重制约了白芨(Bletilla striata)产业的可持续发展。目前,化学农药是防治白芨根腐病的主要措施。但长期使用农药及其在生态系统中的累积,对药材品质、环境和人类健康构成了重大威胁。【目的】开发白芨根腐病的生防制剂,并阐明其抑菌机制,对推动白芨产业的可持续发展意义重大。【方法】从白芨根围土壤分离细菌。采用平板对峙法筛选腐皮镰孢的拮抗细菌。利用盆栽接种试验评估拮抗菌株对白芨根腐病的防治效果。同时,从细胞学、生理生化和微生物学角度揭示该生防细菌对腐皮镰孢的抑制机制。【结果】成功分离出5株对腐皮镰孢具有拮抗作用的细菌,其中菌株SY16的抑菌效果最佳,抑菌率为(75.3±0.4)%。经鉴定,菌株SY16为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)。菌株SY16能有效减少白芨根腐病的发病率及病情指数,8 d后防效仍达92.86%。同时,它还能提高白芨的株高、块茎鲜重和多糖含量。该菌株通过分泌嗜铁素与腐皮镰孢竞争铁元素,释放淀粉酶和蛋白酶破坏菌丝、抑制孢子萌发。同时,菌株SY16能增加白芨根围土壤中细菌和放线菌的数量,减少真菌的数量。【结论】菌株SY16对白芨根腐病展现出显著的生防效果,为定向筛选促生防病的有益菌提供了理论支持。… …   相似文献
315.
【背景】南方根结线虫(Meloidogyne incognita)是我国农作物中最常见的一种根结线虫、危害严重,给设施蔬菜生产造成了巨大经济损失。【目的】分离鉴定用于防治南方根结线虫的植物内生真菌,并验证其生防效果。【方法】采用稀释涂布法分离真菌,利用24孔板液体筛选模型筛选具有抗线虫活性的菌株,通过形态学特征和ITS序列分析进行鉴定,测定其对南方根结线虫卵孵化的抑制作用和2龄幼虫的致死作用,并利用盆栽试验评价其生防效果。【结果】筛选到一株对南方根结线虫具有较强杀线虫活性的菌株JDC158。经形态特征观察、ITS序列分析,将其鉴定为紧密帚枝霉(Sarocladium strictum)。菌株发酵滤液对南方根结线虫卵和2龄幼虫均有高毒杀活性,经原液处理96 h对卵的校正抑制率达86.18%,对2龄幼虫的校正死亡率达97.98%。不同浓度菌株发酵液处理的盆栽防效均高于43.93%,显著优于5%阿维菌素乳油处理,还可以促进黄瓜幼苗生长。【结论】本研究新增了一种防治南方根节线虫的植物内生真菌,为植物线虫病的生物防治提供了新的微生物资源。… …   相似文献
316.
【背景】好氧反硝化细菌在水产养殖尾水处理中显现出广泛的应用潜力。然而,大多数好氧反硝化细菌在高盐环境中的脱氮性能有限。【目的】筛选出耐盐好氧反硝化细菌,并对其脱氮性能进行评估。【方法】从养殖池塘底泥中富集筛选出1株新型高效好氧反硝化细菌,通过16S rRNA基因测序及生理生化试验鉴定菌种;采用动物试验和药敏试验对分离菌进行毒力和耐药性检测,设置不同的环境因素探寻最佳脱氮条件并进行优化,利用固定化技术提高其应用能力。【结果】经鉴定,菌株WM27为产酸克雷伯氏菌(Klebsiella oxytoca),有较高的抗生素敏感性及较好的生物安全性。以琥珀酸钠为碳源,菌株WM27在C/N=10、pH 7.0、温度25 ℃的条件下具有较强的脱氮能力,对总氮(total nitrogen, TN)、NH4+-N、NO2--N和NO3--N的去除率可达到90%以上。该菌株在3%的盐度环境下具有良好的脱氮能力,TN、NH4+-N、NO2--N的去除率仍有88%以上;经固定化菌株WM27的脱氮处理,NH4+-N、NO2--N和NO3--N 48 h的降解效果可分别达到98.62%-99.46%、98.26%-100%和98.34%-100%。【结论】菌株WM27是一株耐盐、安全且高效的好氧反硝化细菌,在高盐养殖尾水处理中具有潜在的应用价值。… …   相似文献
317.
高尿酸血症(hyperuricemia, HUA)是一种常见的代谢性疾病,尿酸过高时会积聚在关节内形成尿酸盐结晶,引发痛风,并可能触发其他健康问题。目前市售降尿酸药物种类繁杂,但普遍存在肾功能损害等副作用。相比之下,活体生物药治疗高尿酸血症的安全性更高、见效更快且具有调节肠道菌群… …   相似文献
318.
  
小麦矮腥黑穗病是由小麦矮腥黑粉菌Tilletia controversa(TCK)侵染引发的麦类腥黑穗病中危害最大、最难防治的一种系统侵染性病害,也是一种重要的国际检疫性小麦病害。对其精准、快速的检测有助于病害检验检疫和防止病害随口岸货物运输传入我国。本研究基于TCK的OR基因特… …   相似文献
319.
  
菌塘是菌根食用菌形成子实体的重要场所,菌塘中存在可以促进菌根形成的微生物,因此对菌塘土壤微生物群落的系统研究和深入分析对于了解食用菌菌根形成至关重要。为明确血红色钉菇菌塘土壤中微生物群落组成和多样性,本研究对血红色钉菇菌塘与非菌塘土壤样品进行扩增子测序,结果显示非菌塘土壤细菌和真菌的Chao 1、Observed species、Shannon、Simpson、Pielou指数显著大于菌塘土壤(P<0.05);菌塘与非菌塘土壤细菌优势门均为变形菌门Proteobacteria,在菌塘土中,变形菌门的相对丰度大于其在非菌塘土中的相对丰度;菌塘与非菌塘土壤优势真菌门为担子菌门Basidiomycota,在菌塘土中,子囊菌门Ascomycota的相对丰度高于非菌塘土;罗兹菌门Rozellomycota的相对丰度是非菌塘土相对丰度的2.94倍;菌塘与非菌塘土壤真菌优势属为红菇属Russula和乳牛肝菌属Suillus,在菌塘中,Leptodontidium属的相对丰度为非菌塘中的1.27倍,青霉属Penicillium的相对丰度为非菌塘中相对丰度的4.47倍,乳牛肝菌属的相对丰度为非菌塘相对丰度的5.72倍,树粉孢属Oidiodendron相对丰度为非菌塘中相对丰度的6.31倍,篮状菌属Talaromyces的相对丰度为非菌塘中相对丰度的18.14倍,其中色钉菇属Chroogomphus和蜡壳耳属Sebacina只存在于菌塘土壤中。LEfSe分析揭示相对于非菌塘土壤,菌塘土壤中共获得26个不同分类水平(1个门、1个纲、4个目、6个科、9个属、5个种)的真菌和20个不同分类水平(2个门、3个纲、3个目、6个科、6个属)的细菌指示类群。共线性网络分析表明菌塘和非菌塘土壤真菌和细菌群落的节点数和边数差异不显著,菌塘土壤中血红色钉菇与细菌ASV20 (变形菌门未培养菌)和真菌ASV22 (绒毛菌属Tomentella)的丰度呈正相关,且相关性较高。研究结果将为血红色钉菇的人工驯化栽培提供理论基础。… …   相似文献
320.
【背景】番茄青枯病是番茄生产上常发的毁灭性病害,可造成番茄减产10%-100%,导致严重的经济损失。【目的】明确生防菌株BB183分类地位及对番茄青枯病的防治效果,为番茄青枯病的防控提供生防微生物资源。【方法】利用形态学特征、生理生化特性、基因组序列比较等方法,确定菌株BB183的分类地位;采用抑菌圈法测定菌株BB183对不同序列变种青枯菌菌株的抑菌活性;通过盆栽试验测定菌株BB183对番茄青枯病的防效及对番茄的促生能力效果;绿色荧光蛋白(green fluorescent protein, GFP)标记菌株测定BB183在番茄根、茎、叶及根际的定殖能力;采用三代PacBio和二代Illumina技术相结合测定菌株BB183基因组。【结果】菌株BB183被鉴定为解脲沙雷氏菌(Serratia ureilytica);该菌株对分属6个序列变种的8株番茄青枯菌(Ralstonia solanacearum)菌株均有抑菌活性,抑菌圈直径1.20-1.69 cm;盆栽试验测定结果表明,菌株BB183对番茄青枯病的防效为51.67%,与20%噻森铜的防效相当,对番茄植株表现出显著的促生效果,并可稳定在番茄根际土壤中定殖。基因组分析结果表明,菌株BB183只包含1个环状的染色体,基因组大小为5 159 039 bp,G+C含量为59.35%,共编码4 664个基因;含有10个不同的次生代谢产物编码基因簇,其中包括3个抗生素类产物合成基因簇,4个铁载体相关产物合成基因簇,1个抗原相关产物合成基因簇和2种潜在的抑菌物质合成基因簇。【结论】筛选获得的生防菌株BB183为解脲沙雷氏菌,对番茄青枯菌具有良好的防治效果,对番茄也有较好的促生能力。… …   相似文献
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